食源性疾病調查的情況正在被全基因組測序所改變,美聯(lián)邦政府稱該方法可以使其更加迅速地鑒別出食源性疾病的來源,防止其他案例再次發(fā)生。
此前,來自患者的樣本被送往各州和聯(lián)邦實驗室,然后由疾病診斷專家查看這些傳染是否由同一種細菌導致。在進行足量對比分析之后,傳染病學家開始詢問患者,尋找導致該疾病的同一種食物來源。
但這樣的測試并不能一錘定音,而把一個傳染案例和另一個案例聯(lián)系在一起又要花費額外的時間。“當這一切在進行時,很多被污染的農產品已經接觸到公眾。”美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)食品安全與應用營養(yǎng)科學實踐辦公室副主任Steven Musser說。
現在,FDA正在構建一個聯(lián)邦州及聯(lián)邦實驗室網絡,以幫助繪制李斯特菌、沙門氏菌和其他食源性病原體的準確DNA。這些測出來的序列會被上傳到位于國立衛(wèi)生研究院的公共數據庫中。該技術不僅可以把一種病原體和其他多種類似菌種區(qū)分開,還可以表明同一個菌株發(fā)生的細微異變。
與此同時,FDA已經開始對日常植物檢查中發(fā)現的病原體進行測序,并把結果加入該數據庫。該機構表示,這種做法的一大優(yōu)點是可以迅速把病人和一次疫病聯(lián)系在一起。另一個優(yōu)勢是,在一些患者生病后,可以辨別發(fā)病源,縮短常規(guī)檢查所需的時間,減少了被感染農產品走上貨架帶來的大面積傳播的風險。